In den vergangenen Jahren hat Next Generation Sequencing (NGS) die molekulargenetische Forschung grundlegend verändert. Die Sequencing Facility des Instituts für Humangenetik am Klinikum rechts der Isar dient primär der Patientenversorgung und wird höchsten Qualitätsansprüchen gerecht. Die Einrichtung betreibt NGS auf dem neuesten Stand der Technik und bietet darüber hinaus NGS-Services für Forschungsprojekte an humanen Proben an.
Unser Team unterstützt bei der Planung Ihrer Projekte. Wir übernehmen die Bearbeitung und Sequenzierung Ihrer Proben und bieten nach Absprache auch bioinformatische Analysen zur Datenauswertung an. Alle Verfahren werden mit diagnostischer Qualität auf einem Illumina NovaSeq 6000 durchgeführt. Die Proben werden in unserem akkreditierten Labor verarbeitet. Zudem verfügt das Institut im Bereich unserer Forschungstätigkeit über einen PromethION für die Long-Read-Sequenzierung.
Die generierten Sequenzdaten werden einer Qualitätskontrolle am Institut für Humangenetik unterzogen und im Standardformat .fastq zur Verfügung gestellt. Falls gewünscht, kann auch eine weiterführende bioinformatische Analyse durch das Institut für Humangenetik durchgeführt werden.
Unser Portfolio umfasst folgende Protokolle:
- Whole Genome Sequencing (Short- und Long-Read-Sequenzierung)
- Whole Exome Sequencing (Twist-Enrichment)
- RNA Sequencing (Short- und Long-Read-Sequenzierung von mRNA)
Für alle Projekte bitten wir um vorherige frühzeitige Kontaktaufnahme.
Dr. Elisabeth Graf
und
Dr. Matias Wagner
PD Dr. Michael Zech